Anar al contingut

TAF15

De L'Enciclopèdia, la wikipedia en valencià


TAF15 (TATA-Binding Protein-Associated Factor 15) és una proteïna humana codificada pel gen TAF15, localisat en el cromosoma 17q12.[1] Forma part del grup de "factors associats a la proteïna d'unió a la caixa TATA" (TATA box protein, TBP), integrant-se en el complex multiproteico TFIID, essencial per a la transcripció des de el ADN a ARN mediada per l'ARN polimerasa II.[1][2] TAF15 pertany a la <o>família FET de proteïnes</o>, junt en les proteïnes FUS i EWSR1, un grup evolutivamente conservat de proteïnes d'unió al ARN que eixerciten funcions regulatorias en distints processos celulars.[2] Estes proteïnes es caracterisen per la seua capacitat per a interactuar en àcits nucleicos i en múltiples factors de transcripció, participant tant en la regulació de l'expressió gènica com en l'organisació estructural del núcleu celular.[2]
L'interés científic per TAF15 ha aumentat per la seua implicació en diverses malalties neurodegenerativas i en alguns tipos de sarcomas, aixina com pel seu paper en la formació de condensados biomoleculars i en els mecanismes de resposta a l'estrés celular.[3][4]

Estructura

La proteïna TAF15 presenta una arquitectura modular típica de la família FET de proteïnes, que combina dominis estructurats d'unió al ARN en regions intrínsecament desordenades.[2] Esta organisació li otorga una gran versatilitat funcional, permetent-li participar en diferents contexts moleculars dins del núcleu celular.[1][4][5][6]

La seqüència de la TAF15 inclou motius conservats que medien interaccions en ARN i atres proteïnes, aixina com regions flexibles que faciliten la formació de complexos de ribonucleoproteínas i de condensados biomoleculars.[3][4]

Estes característiques estructurals seran fonamentals per a comprendre la seua funció reguladora i les seues implicacions en la transcripció i en diverses patologies humanes.[2][3]

Organisació genómica

El gen TAF15 (també conegut com RBP56 o TAF2N) es localisa en el cromosoma 17q12 del genoma humà i codifica una proteïna d'aproximadament 592 aminoàcits en el seu isoforma principal.[1][2]
Té una extensió aproximada de 25 kilobases i està format per múltiples exones que poden sofrir processos d'empalme alternatiu, donant lloc a diferents transcritos segons el tipo celular i les condicions fisiològiques.[1][6]

El gen mostra una alta conservació evolutiva entre espècies de vertebrats, lo que sugerix una funció biològicament rellevant i mantinguda a lo llarc del temps.[4][5][6]

Dominis estructurals

Motiu de reconeiximent de ARN (RRM)

TAF15 conté un o més dominis de reconeiximent d'ARN (RRM, Motiu de reconeiximent de ARN), situats en la regió central de la proteïna (aproximadament entre els aminoàcits 230 i 317).[1][2][6][7]

El domini RRM presenta l'arquitectura clàssica β₁–α₁–β₂–β₃–α₂–β₄, en un núcleu α/β format per fulls β antiparalelas flanquejades per hèlices α.[2][8] Este domini conté els motius conservats RNP1 i RNP2, responsables de l'interacció en el ARN, encara que en TAF15 estos motius posseïxen únicament dos residus aromàtics (F237 i F290), lo que sugerix un modo d'unió al ARN diferent al d'atres RRMs.[1][6][8]

Estructura de TAF15. Regions roses i roges: es coneix la seua estructura. Regions blaves: la seua estructura és encara desconeguda

Ademés, el RRM de TAF15 presenta una expansió en el bucle LA ("KK-loop"), que contribuïx al reconeiximent d'estructures secundàries de ARN, com forquetes riques en AU (pares de bases adenina-uracilo), proporcionant especificidad d'unió.[6][7][8]

Regions riques en glicina i serina

Les regions en abundància de glicina i serina conferixen flexibilitat estructural a la proteïna, permetent-li adaptar-se a distints entorns moleculars i establir interaccions en uns atres complexos reguladors, com TFIID.[2][7][9]

Estes regions són típiques de proteïnes intrínsecament desordenades que funcionen com a plataformes d'interacció.[1][2]

Regions intrínsecament desordenades i motius funcionals

En el seu extrem amino-terminal (N-terminal), TAF15 posseïx una regió xxxx en glutamina (Q), glicina (G), serina (S), i tirosina (I), coneguda com a domini QGSY, que es considera intrínsecament desordenada.[2][4] Este domini contribuïx tant a l'activació transcripcional com a la formació de complexos proteics per mig d'interaccions multivalentes.[2][9]

En l'extrem Carboxi-terminal (C-terminal), la proteïna presenta un motiu RGG (arginina-glicina-glicina) i un dit de zinc tipo RanBP2 (entre els aminoàcits 351 i 381).[2][4][10]

Abdós regions carixen d'una estructura secundària estable i favorixen les interaccions proteïna-proteïna i proteïna-ARN, sent essencials en la regulació postranscripcional.[2][4][6][11]

Propietats estructurals i funcionals adicionals

La regió de baixa complexitat (LCD, low-complexity domain) en l'extrem C-terminal de TAF15 pot sofrir processos de separació de fases (phase separation), permetent la formació de compartiment funcionals sense membrana que participen en la regulació de la transcripció i el metabolisme de el ARN.[4][10][12]

Diversos estudis han mostrat que el domini LCD de TAF15 (per eixemple, residus en la seua regió de baixa complexitat, residus 7-99) pot formar filaments amiloides funcionals, composts per tretze bri β per molècula en registre, relacionant l'arquitectura estructural de la proteïna en mecanismes moleculars involucrats en malalties neurodegenerativas.[4]

La localisació nuclear predominant de TAF15 s'associa a senyals de localisació nuclear presents en els seus dominis desordenats, mentres que el motiu RGG facilita l'interacció en proteïnes de splicing i reparació de el ADN, com SRPK1, integrant aixina funcions de regulació transcripcional i postranscripcional.[2][4][13]

Expressió i regulació de gens

La proteïna TAF 15 és codificada pel gen TAF 15. La transcripció d'este gen està regulada per factors de transcripció, promotors, senyals epigenéticas, etc.[14][15]

La metilació (del promotor o de factors) pot favorir la localisació nuclear i la regulació positiva de l'activitat transcripcional de TAF15.[15]

Una volta s'ha generat l'ARNm codificante para TAF15 en el procés de transcripció, est deu ser processat, deu passar per un procés de maduració (es tallen els intrones del gen, hi ha una poliadenilación i es empalman els exones). Després s'exporta al citoplasma per a la seua traducció.[15][13]

En la citoplasma, els ribosoma traduïxen el ARNm de TAF15 en la cadena polipeptídica corresponent.

La proteïna recent sintetisada pot tindre senyales de localisació (per eixemple, nuclear) i dominis funcionals rellevants com poden ser dominis d'unió a RNA, regions de baixa complexitat (low-complexity), RRM (RNA recognition motif) que li dona especificidad a l'unió, etc.[12][10]

Una volta sintetisada, TAF15 es localisa principalment en el núcleu, a on pot associar-se al complex TFIID (TATA-box binding protein–associated factor) com a part del complex d'iniciació de la transcripció per la ARN polimerasa II. També s'ha detectat en la citoplasma en certs tipos celulars.[14]

Regulació funcional
  • En condicions d'estrés TAF15 pot traslladar-se a la citoplasma i participar en la formació de “stress granules” (grànuls d'estrés), a on podria afectar la traducció o estabilitat de ARN.[9][14]
  • TAF15 té un domini LC que regula la separació de fases depenent de la seua concentració, estat de fosforilación i interacció en el RNA.[12]

Regulació negativa: Com qualsevol proteïna celular, TAF15 està subjecta a degradació proteasómica o lisosomal; estes regulacions negatives poden vindre de microARNs, lncRNAs, circRNAs que modulen la seua expressió o efecte.

Referències

  1. ↑ 1,0 1,1 1,2 1,3 1,4 1,5 1,6 1,7 National Center for Biotechnology Information (NCBI) (ed.): «TAF15 TATA-box binding protein associated factor 15 [ Homo sapiens (human) ]» (en inglés). NCBI Gene. Consultat el 30 d'octubre 2025.
  2. ↑ 2,00 2,01 2,02 2,03 2,04 2,05 2,06 2,07 2,08 2,09 2,10 2,11 2,12 2,13 2,14 European Bioinformatics Institute (EBI) / Swiss Institute of Bioinformatics (UniProt) (ed.): «TAF15 – TATA‑binding protein‑associated factor 2N (Q92804)» (en inglés). UniProt. Consultat el 28 d'octubre de 2025.
  3. ↑ 3,0 3,1 3,2 «Biochemical Properties and Biological Functions of FET Proteins».Annual Review of Biochemistry.84
    355‑379.doi:10.1146/annurev-biochem-060614-034325.Consultat el 30 d'octubre. .
  4. ↑ 4,00 4,01 4,02 4,03 4,04 4,05 4,06 4,07 4,08 4,09 Tetter, Stephan«TAF15 amyloid filaments in fronto temporal lobar degeneration».Nature.625
    345‑351.doi:10.1038/s41586-023-06801-2.Consultat el 28 d'octubre de 2025.
    .
  5. ↑ 5,0 5,1 EMBL‑EBI / Ensembl. «TAF15 — Homo sapiens (Human) Gene Summary — ENSG00000270647» (en inglés). Ensembl. Consultat el 2 de novembre de 2025.
  6. ↑ 6,0 6,1 6,2 6,3 6,4 6,5 6,6 «Structural delineation of stem-loop RNA binding by human TAF15 protein».Scientific Reports.5(17298)Consultat el 31 d'octubre de 2025..
  7. ↑ 7,0 7,1 7,2 «hTAF(II)68, a novell RNA/ssDNA-binding protein with homology to the pro-oncoproteins TLS/FUS and EWS is associated with both TFIID and RNA polymerase II».The EMBO journal.European Molecular Biology Organization; Nature Publishing Group UK; First Second.15(18)
    5022–5031.doi:10.1002/j.1460-2075.1996.tb00882.x.Consultat el 31 d'octubre de 2025. .
  8. ↑ 8,0 8,1 8,2 .
  9. ↑ 9,0 9,1 9,2 Kato, Masato«Cell-free Formation of RNA Granules: Low Complexity Sequence Domains Form Dynamic Fibers within Hydrogels».Cell.149(4)
    753–767.doi:10.1016/j.cell.2012.04.017.Consultat el 31 d'octubre de 2025. .
  10. ↑ 10,0 10,1 10,2 «Analysis of the RNA-recognition motif and RS and RGG domains: conservation in metazoan pre-mRNA splicing factors».Nucleic Acids Research.21(25)
    5803–5816.doi:10.1093/nar/21.25.5803.Consultat el 31 d'octubre de 2025. .
  11. ↑ Patel, Avinash«A Liquid-to-Solid Phase Transition of the ALS Protein FUS Accelerated by Disease Mutation».Cell.162(5)
    1066–1077.doi:10.1016/j.cell.2015.07.047.Consultat el 31 d'octubre de 2025. .
  12. ↑ 12,0 12,1 12,2 «Phase Separation of TAF15 C-Terminal LC Domain Enables RNA-Binding Protein-Mediated Transcriptional Regulation».FASEB Journal.39(20)doi:10.1096/fj.202502096R.Consultat el 4 de novembre de 2025. .
  13. ↑ 13,0 13,1 «SR Protein Kinase 1 Inhibition by TAF15».Cells.12(1)doi:10.3390/cells12010126.Consultat el 2 de novembre de 2025..
  14. ↑ 14,0 14,1 14,2 «Gene expression responses to FUS, EWS, and TAF15 reduction and stress granule sequestration analyses identifies FET-protein senar-redundant functions».PLoS ONE.7(9)
    i46251.doi:10.1016/j.bbrc.2009.05.009.Consultat el 4 de novembre de 2025. .
  15. ↑ 15,0 15,1 15,2 «PRMT1 mediated methylation of TAF15 is required for its positive gene regulatory function».Experimental Cell Research.315(7)
    1273-1286.doi:10.1016/j.yexcr.2008.12.008.Consultat el 30 d'octubre de 2025.
  16. ↑ «TATA-box-binding protein-associated factor 15 is a novell biomarker that promotes cell proliferation and migration in gastrointestinal stromal tumor».World Journal of Gastroenterology.29(19)
    2932-2949.doi:10.3748/wjg.v29.i19.2932.Consultat el 1 de novembre de 2025. .
Obtingut de «https://lenciclopedia.org/w/index.php?title=TAF15&oldid=1503601»