Caixa TATA
La caixa TATA (també denominada en anglés TATA box o Goldberg-Hogness box)[1] és una seqüència d'ADN (seqüència consens; consensus sequence, en anglés) trobada en la regió promotora de gens d'estoves, bactèries i eucariota.[2] S'estima que, aproximadament el 24 per cent dels genés humans contenen la caixa TATA en els seus respectius promotors.[3]
Considerada com la principal seqüència del promotor, és el lloc d'unió tant dels factors de transcripció com de les histona (l'unió de factors de transcripció bloqueja l'unió de les histona i viceversa) i està implicada en el procés de transcripció per l'ARN polimerasa. Es tracta d'un promotor focalizado. Este tipo de seqüències es troben en, aproximadament, 1/3 del total de gens humans transcritos. És específica de gens regulats, i sobre ella s'establix el PIC (Complex de Preinicio), format per la ARN polimerasa II i les seues GTFs (Factors Generals de la Transcripció).
Característiques
[editar | editar còdic]La caixa TATA presenta una seqüència consens del tipo 5'-TATAAA-3', que és seguida generalment per tres o més adeninas. Se situa normalment uns 25 parells de bases riu dalt del lloc d'inici de la transcripció. Es pensa que esta seqüència consens s'ha mantingut pràcticament invariable a lo llarc del procés evolutiu, havent-se originat possiblement en un organisme eucariota ancestral.
Habitualment, la caixa TATA es troba unida a la proteïna d'unió a TATA (TBP) durant el procés de transcripció. TBP desenrolla l'ADN i ho plega uns 80°. La seqüència rica en AT de la caixa TATA facilita dit desenrollamiento (degut a que l'adenina i la timina només conformen dos ponts d'hidrogen en el bri complementari en lloc dels tres que conformen la guanina i la citosina). TBP s'unix a el ADN d'un modo inusual ya que ho fa en la regata menor, per mig d'una beta-làmina.
La caixa TATA també sol ser el lloc d'unió de l'ARN polimerasa II. El factor de transcripció TFIID s'unix a la caixa TATA, seguit per l'unió de TFIIA en una regió corrent dalt respecte de TFIID. TFIIB pugues llavors unir-se a una atra regió corrent avall respecte de TFIID. La polimerasa pot llavors reconéixer este complex multiproteico i unir-se a ell, junt en atres factors de transcripció tals com TFIIF, TFIIE i TFIIH. A partir d'eixe moment, la transcripció dona començ i la polimerasa alvança a lo llarc del bri de ADN, deixant a TFIID i a TFIIA units a la caixa TATA, lo que pot facilitar l'unió de molècules de ARN polimerasa II adicionals.
Este conjunt de ARN polimerasa II i diversos factors de transcripció és conegut com a complex de transcripció basal (BTC). En este estat, només es produïx un baix nivell de transcripció. Atres factors deuen estimular el BTC per a aumentar els nivells de transcripció. Un eixemple de regió de ADN estimulant de BTC en la caixa CAAT.
La majoria de gens no posseïxen caixa TATA i utilisen en el seu lloc un motiu iniciador o un promotor downstream. En qualsevol cas, TBP sempre està involucrat, veent-se forçat a unir-se inclús en aquells casos en els que no existix especificidad de seqüència. Un estudi del genoma ha conclós que el número de promotors depenents de caixa TATA ronda el 10%.[4] No obstant, un atre estudi més recent portat a terme sobre 1000 gens ha trobat un 32% de promotors que posseïxen caixa TATA.[5]
Unió de histona
[editar | editar còdic]L'unió d'histonas involucra a l'extrem N-terminal de la histona H4.
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ Lifton RP, Goldberg ML, Karp RW, Hogness DS. (1978). The organization of the histone gens in Drosophila melanogaster: functional and evolutionary implications. Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 42, 1047-1051. PMID 98262
- ↑ Smale ST, Kadonaga JT (2003). The RNA polymerase II core promoter. Annu Rev Biochem., 72, 449-479. PMID 12651739 PDF
- Archivat el 31 de octubre de 2006 archivat en Wayback Machine.
- ↑ Yang C, et al. (2007) Prevalence of the initiator TATA box in the human and yeast gens and identification of DNA motifs enriched in human TATA-less core promoters. Gene. 389, 52-65. PMID 17123746 [1]
- ↑ Carninci P, Sandelin A, Lenhard B, et al.'Nat. Genet..38(6)
- 626–35.doi:10.1038/ng1789.
- ↑ Suzuki I, Tsunoda T, Sese J, et al.'Genome Res..11(5)
- 677–84.doi:10.1101/gr.164001.
- Este artícul conté una traducció derivada de «Caja TATA» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.