Viroma humà
El viroma humà és la colecció total de virus en i sobre el cos humà.[3][4] Els virus en el cos humà poden infectar tant les cèlules humanes com uns atres microbis, com les bactèries (bacteriòfecs).[5] Alguns virus causen malalties, mentres que uns atres poden ser asintomáticos. Certs virus també s'integren en el genoma humà com provirus o elements virals endógenos.
Els virus evolucionen ràpidament i, per lo tant, el viroma humà canvia constantment.[6] Cada ser humà té un viroma únic en un equilibri únic d'espècies.[3][7] L'estil de vida, l'edat, l'ubicació geogràfica i inclús l'estació de l'any poden afectar l'exposició d'un individu als virus, i la susceptibilitat d'un a qualsevol malaltia que puga ser causada per eixos virus també es veu afectada per l'immunitat preexistente i la genètica viral i humana.[8]
El viroma humà està llunt d'estar completament explorat i en freqüència es descobrixen nous virus. A diferència dels aproximadament 40 billons de bactèries en un microbioma humà típic,[9] encara no es dispon d'una estimació del número de partícules virals en un humà adult sà, encara que els viriones generalment superen en número a les bactèries individuals 10:1 en la naturalea. L'estudi del viroma es creu que proporcionarà una comprensió dels microbis en general i cóm afecten la salut i la malaltia humana.
Métodos i ferramentes
[editar | editar còdic]Hi ha varis métodos disponibles per a l'aïllament i l'estudi de virus humans:
- La seqüenciació profunda és una tècnica de seqüenciació ràpida de ADN que és útil per a caracterisar la riquea del viroma, l'estabilitat, la funció del gen i l'associació en fenotips de malalties.[4] Esta tecnologia crea grans cantitats d'informació de seqüència i és capaç de detectar components rars d'una comunitat microbiana. Els métodos actuals que combinen l'eliminació de ADN humà i bacterià de les mostres, la seqüenciació a gran escala i la bioinformática són molt eficients en l'identificació de virus desconeguts.[10] A diferència d'atres métodos de descobriment, els virus no necessiten créixer en cultius celulars. Sense cap coneiximent previ de la seqüència del genoma o els métodos de creiximent, es poden descobrir nous virus. Per lo tant, la seqüenciació profunda és adequada per a l'identificació ràpida d'un virus desconegut o inesperat involucrat en un brot de malaltia o associat en afeccions que no es consideren causades per virus. La seqüenciació profunda també permet proyeccions a gran escala en un mínim esforç pràctic.[11] Una exploració sistemàtica dels virus que infecten als humans (el viroma humà) és important i factible en estos métodos.
- La reacció en cadena de la polimerasa és una ferramenta per a amplificar i detectar seqüències de ADN específiques. Es pot usar per a ajudar a caracterisar el viroma, pero està llimitat per la necessitat d'informació de seqüència de ADN a lo manco parcial.
- El metagenoma humà inclou tots els organismes que viuen en nosatres. Els virus contribuïxen al metagenoma i establixen una infecció crònica que infesta els cromosomes; Este método formularà una nova estimació del número de gens que conferixen susceptibilitat a un virus determinat i especificarà alels per a alguns virus.[12][13]
- Els estudis d'anticossos a gran escala en ELISA usant sanc donada podrien ajudar a determinar l'exposició humana a virus particulars en diferents regions geogràfiques.[8]
Diversitat de virus humans
[editar | editar còdic]
El viroma humà no és estable i pot canviar en el temps. De fet, nous virus es descobrixen constantment.[8][15][16] En un número cada volta major de virus coneguts, el diagnòstic i el tractament de noves afeccions associades a virus també seran més fàcils.[17][18] Estudiar el viroma podria ajudar a millorar el desenroll de fàrmacs i llimitar l'us d'antibiòtics.[3][19]
Un dels primers estudis que va utilisar la seqüenciació de ADN d'alt rendiment per a descriure la diversitat dels virus de ADNds eucariota en individus normals va incloure 706 mostres de 102 subjectes.[14] Este estudi va detectar un promig de 5.5 gèneros virals en cada individu i estos virus varen incloure herpesvirus, papilomavirus, poliomavirus, adenovirus, anellovirus, parvovirus i circovirus.
Cada individu tenia un perfil viral distint, lo que demostra l'alta diversitat interpersonal del viroma. Es varen detectar d'un a 15 gèneros virals (promig 5.5) en el 92% dels 102 individus muestreados (Figura 2).[14] La Figura 3 ilustra els viromas dels 102 individus definits per mig del mostreig de fins a cinc hàbitats corporals principals, mostrant que es va detectar una àmplia gama de virus en persones sanes (Figura 3).
Els 102 individus portaven sèt famílies distintes de virus de ADN humà (Figura 4A).[14] Les seqüències es varen detectar predominantment en el nas i la pell, similitut en 17 gèneros de virus del papiloma (Figura 4B). Els rosolovirus, predominantment HHV-7 i, en menor mida, HHV-6, varen estar presents en el 98% dels individus que varen proporcionar mostres de boca.
Ademés, els mateixos virus varen prevaldre en múltiples hàbitats corporals dins dels individus. Per eixemple, els virus del papiloma beta i gamma varen ser els virus més comunament trobats en la pell i el nas (Figura 4A, B), que poden reflectir proximitat i similituts en microambientes que recolzen l'infecció en estos virus.[14]
El viroma de la sanc humana
[editar | editar còdic]Les senyes de seqüenciació del genoma complet de sanc de 8,240 individus sense cap malaltia infecciosa clara varen revelar 94 virus diferents en el 42% dels participants de l'estudi. Les seqüències varen incloure 19 virus de ADN humà, provirus i virus de ARN (herpesvirus, anellovirus, papilomavirus, tres poliomavirus, adenovirus, VIH, HTLV, hepatitis B, hepatitis C, parvovirus B19 i virus de la influenza).[20] De possible rellevància per a la medicina de transfusions, este estudi va identificar el poliomavirus de cèlules de Merkel en 49 individus, el virus del papiloma en sanc de 13 individus, el parvovirus B19 en 6 individus i la presència d'herpesvirus 8 en 3 individus.
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ «Human AND RNA Virus - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Consultat el 15 de novembre de 2016.
- ↑ «bacteriophage - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Consultat el 15 de novembre de 2016.
- ↑ 3,0 3,1 3,2 Proceedings of the National Academy of Sciences.110(8)
- 2682–2684.doi:10.1073/pnas.1300923110.
- ↑ 4,0 4,1 (2012).Translational Research.159(6)
- 430–453.doi:10.1016/j.trsl.2011.12.009.
- ↑ The ISME Journal.6(5)
- 915–926.doi:10.1038/ismej.2011.169.
- ↑ Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences.367(1604)
- 2864–2871.doi:10.1098/rstb.2011.0354.
- ↑ Zimmer. «Your Inner Lions: Get to Know Your Virome». National Geographic. Archivat des d'el original, el 10 de febrer de 2013. Consultat el 29 d'abril de 2013.
- ↑ 8,0 8,1 8,2 PLoS Pathogens.9(2)
- i1003146.doi:10.1371/journal.ppat.1003146.
- ↑ Cell.164(3)
- 337–40.doi:10.1016/j.cell.2016.01.013.
- ↑ (2009).Nature Protocols.4(4)
- 470–483.doi:10.1038/nprot.2009.10.
- ↑ Proceedings of the National Academy of Sciences.102(36)
- 12891–12896.doi:10.1073/pnas.0504666102.
- ↑ Cell.138(1)
- 30–50.doi:10.1016/j.cell.2009.06.036.
- ↑ (2010).Trends in Microbiology.18(1)
- 11–19.doi:10.1016/j.tim.2009.11.003.
- ↑ 14,0 14,1 14,2 14,3 14,4 14,5 14,6 BMC Biology.12
- 71.ISSN 1741-7007.doi:10.1186/s12915-014-0071-7.
- ↑ Emerging Infectious Diseases.9(7)
- 768–773.doi:10.3201/eid0907.030004.
- ↑ Dalke. «The Human Virome». Genome News Network. Consultat el 2 d'abril de 2013.
- ↑ Cell.151(2)
- 253–66.doi:10.1016/j.cell.2012.09.024.
- ↑ Science.331(6024)
- 1513.doi:10.1126/science.331.6024.1513.
- ↑ PLOS Pathogens.13(3)
- i1006292.ISSN 1553-7374.doi:10.1371/journal.ppat.1006292.
- Este artícul conté una traducció derivada de «Viroma humano» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.