RNA-Seq

First, cellular mRNA is extracted and fragmented into smaller mRNA sequences, which undergo reverse transcription. The resulting cDNAs llaure sequenced on a Next Generation Sequencing (NGS) platform. The results of such sequencing allow the generation of transcriptomic sequencing genomic maps.

Tècnica experimental de seqüenciació del transcriptoma (RNA-seq)

RNA-seq ( «seqüenciació de ARN» ), també cridat Seqüenciació del Transcriptoma Sancer per a Clonació a l'Encert (del anglés Whole Transcriptome Shotgun Sequencing ), utilisa la seqüenciació massiva (NGS) per a revelar la presència i cantitat de ARN, en una mostra biològica en un moment donat.

Aixina, la RNA Seq usa per a analisar canvis en el transcriptoma. Concretament, la RNA-seq facilita l'observació de transcritos resultants del empalme alternatiu, modificació postranscripcional, fusiones gèniques, mutacions/polimorfisme de nucleòtits únics i canvis d'expressió de gens. Ya que el procés implica l'obtenció de RNA total, la RNA Seq pot ajudar a caracterisar poblacions diferents de RNA com miRNA, tRNA, i rRNA Esta tecnologia, ademés, també pot servir per a determinar les fronteres exón / intrón i verificar o esmenar regions 5 'i 3'.

Les senyes obtingudes per mig de RNA-seq han segut útils per a la realisació de numerosos estudis. En un artícul publicat en 2019 en la revista Nature communications s'utilisen senyes de ARN-seq per a estudiar les firmes transcriptómicas de diferents membres de el MTBC. Els resultats obtinguts en este estudi mostren que els diferents clados MTBC tenen la seua pròpia firma transcriptómica.