PROSITE
PROSITE és una base de senyes de famílies i dominis de proteïnas creada per Amos Bairoch en 1988.[1][2] Consistix en entrades que descriuen dominis, famílies i llocs funcionals aixina com patrons d'aminoàcits. Estos són manualment verificats per un equip del Institut Suís de Bioinformática i integrat en la base de senyes de Swiss-Prot.
Els seus usos inclouen l'identificació de possibles funcions de les proteïnes recentment descobertes i l'anàlisis d'aquelles ya conegudes pero en activitats prèviament desconegudes. PROSITE oferix ferramentes per a l'anàlisis de seqüències de proteïnes i detecció de motius de proteïnes; és part dels servidors d'anàlisis de proteómica d'ExPASy.
La base de senyes ProRule es basa en les descripcions de domini de PROSITE.[3] Esta proporciona informació adicional sobre funcionalitats o d'aminoàcits estructuralment crítics. Les regles contenen informació sobre els residus biològicament significatius, com a llocs actius, llocs d'unió a substrat o cofactorés, modificacions postraduccionales o enllaços disulfuro, per a ajudar a determinar la funció. Estes poden automàticament generar anotacions basats en els motius de PROSITE.
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ De Castro I, Sigrist CJA, Gattiker A, Bulliard V, Langendijk-Genevaux PS, Gasteiger I, Bairoch A, Hulo N(2006).Nucleic Acids Res..34(Web Server issue)
- W362–365.doi:10.1093/nar/gkl124.
- ↑ Hulo N, Bairoch A, Bulliard V, Cerutti L, Cuche B, De Castro I, Lachaize C, Langendijk-Genevaux PS, Sigrist CJA(2007).Nucleic Acids Res..36
- D245.doi:10.1093/nar/gkm977.
- ↑ Sigrist CJ, De Castro I, Langendijk-Genevaux PS, Li Saux V, Bairoch A, Hulo N(2005).Bioinformatics..21(21)
- 4060–4066.doi:10.1093/bioinformatics/bti614.
- Este artícul conté una traducció derivada de «PROSITE» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.