Motiu ARN asd
El motiu ARN asd és una estructura conservada d'ARN trobada en lactobacillales. El motiu asd va ser detectat per métodos bioinformaticos.[1] Un ARN asd individual va ser localisat en Estreptococ pyogenes per mig de les tècniques de northern blot i microarray, i caracterisat com una molècula de 170 nucleòtits anomenada "SR914400".[2] El lloc d'inici de la transcripció determinat per a SR914400 correspon a l'extrem 5′ de la molècula mostrada en l'image. Pertany a la família de molècules de el ARN RF01732.
Alguns ARNasd estan associats a gens, com el gen asd, lo que sugerix una funció reguladora en cis.[3] En qualsevol cas, vàries llínees apunten a que este no és paper biològic d'estes estructures. En primer lloc, en alguns casos el ARNasd no està en l'extrem 5' de la regió no traduïda de cap dels gens indicats. Segon, en Estreptococ mutans, hi ha un promotor fort immediatament aigües avall del terminador de la transcripció que seguix a el ARNasd, i este promotor[4] precedix a la seua volta al gen aigües avall. Esta configuració sugerix que la transcripció de el ARNasd és terminal, i el gen es transcribe aigües avall del promotor. Finalment, a pesar de que el gen asd codifica una enzima, la aspartato-semialdehido dehidrogenasa, que participa en la síntesis de metionina, lisina i treonina, els nivells de transcripció del gen asd permaneixen constants inclús quàn les concentracions d'estos aminoàcits fluctuen.
Referències
- ↑ (març de 2010).«Comparative genomics reveals 104 candidate structured RNAs from bactèria, archaea, and their metagenomes».Genome Biology.11(3): R31.doi:10.1186/gb-2010-11-3-r31.
- ↑ (novembre de 2009).«A genome-wide analysis of small regulatory RNAs in the human pathogen group A Streptococcus».PLOS One.4(11): i7668.doi:10.1371/journal.posa.0007668.
- ↑ (maig de 2015).«Single nucleotide resolution RNA-seq uncovers new regulatory mechanisms in the opportunistic pathogen Streptococcus agalactiae».BMC Genomics.16(1): 419.doi:10.1186/s12864-015-1583-4.
- ↑ (març de 1987).«Nucleotide sequence of the asd gene of Streptococcus mutans. Identification of the promoter region and evidence for attenuator-like sequences preceding the structural gene».The Journal of Biological Chemistry.262(7): 3344–53.
- Este artícul conté una traducció derivada de «Motivo ARN asd» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.