Logo de seqüències
En bioinformática, un logo de seqüències és una representació gràfica de la conservació d'una seqüència de nucleòtits (en una cadena d'ADN o d'ARN), o d'aminoàcits (en seqüències de proteïnas).
Per a crear logos de seqüències, les seqüències relacionades de ADN, ARN o proteïnes, o be seqüències de ADN que compartixen llocs d'unió conservats, són alineades fins que les parts més conservades creen bons alineamientos. Es pot crear llavors un logo de seqüències a partir del alineamiento múltiple de seqüències conservades. El logo de seqüències posarà de manifest el grau de conservació dels residus en cada posició: un menor número de residus diferents provocarà major tamany en les lletres, ya que la conservació és millor en eixa posició. Els residus diferents en la mateixa posició s'escalaran d'acort a la seua freqüència. Els logos de seqüències poden usar-se per a representar llocs conservats d'unió a el ADN, a on queden units els factors de transcripció.
Segons lo vist, les lletres de major altura representaran residus únics. Ademés, i per consens, les bases més conservades (les de major freqüència d'aparició i, per lo tant, les més provables per a eixa determinada posició) es representen en la part més alta de les piles de residus i, a l'inversa, les menys conservades aniran ocupant, de forma proporcional, les posicions inferiors.
També en la Wikipedia
[editar | editar còdic]
Referències
[editar | editar còdic]- Este artícul conté una traducció derivada de «Logo de secuencias» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.