Formatdb
Formatdb és una ferramenta software de bioinformática molecular per a formatear bases de senyes de proteïnes o nucleòtits per a que puguen ser utilisades per BLAST.
Segons la seua pàgina man (manual d'alguns comandos o aplicacions Unix), formatdb deu usar-se per a formatear estes bases de senyes ans que puguen ser analisades per BLAST.[1] La base de senyes font deuria estar be en format FASTA, be en format ASN.1. Encara que el format FASTA és l'usat més a sovint com a entrada de formatdb, l'us de ASN.1 té ventages per a aquells que ho estiguen utilisant com a font comuna per a atres formats, tals com l'informe (report) de GenBank.
Segons el NCBI, este programa està desactualizado ya que ha segut reemplaçat per makeblastdb.[2]
Referències
- ↑ Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ(1990).«Basic local alignment search tool».215(3)
- 403–410.
- ↑ «BLAST Command Line Applications User Manual». NCBI Bookshelf.
- Este artícul conté una traducció derivada de «Formatdb» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.