Chip de ADN
Un chip de ADN (del anglés DNA microarray) és una superfície sòlida a la qual s'unix una colecció de fragments d'ADN. Les superfícies amprades per a fixar el ADN són molt variables i poden ser de vidre, plàstic i inclús de silicona. Els chips de ADN s'usen per a analisar l'expressió diferencial de gens, i es monitorizan de manera simultànea els nivells de mils d'ells. El seu funcionament consistix, bàsicament, en medir el nivell d'hibridació entre la sonda específica (probe, en anglés), i la molècula diana (target), i s'indiquen generalment per mig de fluorescència i a través d'un anàlisis d'image, la qual cosa indica el nivell d'expressió del gen.
Solen utilisar-se per a identificar gens en una expressió diferencial en condicions distintes. Per eixemple, per a detectar gens que produïxen certes malaltiaés per mig de la comparació dels nivells d'expressió entre cèlulas sanes i cèlules que estan desenrollant certs tipos de malalties. Un eixemple de la seua aplicació és en SNPs arrays per a polimorfisme en malalties cardiovasculars, càncer, patógenos i anàlisis GWAS. També per a identificació de variacions estructurals i medició d'expressió de gens.
Antecedents històrics
[editar | editar còdic]La tecnologia del chip de ADN té el seu orige en una tècnica molt usada en biologia molecular, el Southern blot. En l'era pregenómica la biologia estudiava els gens individualment, un a un, per lo que els podia estudiar a fondo. Lo que caracterisa l'era postgenómica no és lo que es pot medir sino la cantitat de medicions simultànees que es poden realisar. Per a complir este objectiu i poder estudiar molts gens al mateix temps va ser necessari un canvi de paradigma: en els mateixos recursos, obtindre una image de menor resolució pero en una perspectiva més general.
Fabricació
[editar | editar còdic]Els chips de ADN es fabriquen usant una gran varietat de tecnologies. El gran desenroll d'esta tècnica ha aplegat en normalisar-se l'us de robots que s'encarreguen de la major part del procés de manipulació dels chips (sintetisar el ADN mòle que s'unix al chip, unir-ho, afegir els reactius necessaris, etcétera).
Els chips de ADN es poden usar per a detectar ARN, que pot traduir-se o no en proteïnes. Els científics es referixen a esta classe d'anàlisis com anàlisis d'expressió o anàlisis del transcriptoma, i té per objecte establir un patró o perfil dels gens transcritos presents en un tipo de cèlules determinat.[1] Se sol retrotranscribir el ARN a ADN per a estos casos, de manera que lo que s'utilisa com a mostra és ADNc.
L'us de chips de ADN per a estudiar l'expressió de diversos gens es va publicar en 1995,[2] en la prestigiosa revista científica Science, i el primer organisme eucariota en tot el genoma (Saccharomyces cerevisiae) dispost en un chip de ADN es va publicar en 1997[3] en la mateixa revista.
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ Mattei, J.-F. (2001/2002). El genoma humà (Ethical eye: the human genome). Sáez García, M. A.; Chao Crecente, M.; Vázquez, D. A., i Rodríguez-Roda Stuart, J., trad. Colecció La Mirada de la Ciència. Madrit: Council of Europe/Editorial Complutense. Glossari (p. 201). ISBN 84-7491-665-8
- ↑ Schena M, Shalon D, Davis RW, Brown PO (1995). "Quantitative monitoring of gene expression patterns with a complementary DNA microarray". Science 270 (5235): 467–470. doi:10.1126/science.270.5235.467. PMID 7569999.
- ↑ Lashkari DA, DeRisi JL, McCusker JH, Namath AF, Gentile C, Hwang SY, Brown PO, Davis RW (1997). Yeast microarrays for genome wide parallel genetic and gene expression analysis. Proc Natl Acad Sci USA, 94(24): 13057–13062. doi:10.1073/pnas.94.24.13057. PMID 9371799.
- Este artícul conté una traducció derivada de «Chip de ADN» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.