Anar al contingut

UCSF Chimera

De L'Enciclopèdia, la wikipedia en valencià
UCSF Chimera

UCSF Chimera (o simplement Chimera) és un programa extensible per a la visualisació interactiva i l'anàlisis d'estructures moleculars i senyes relacionades, incloent mapes de densitat, ensamblages supramoleculares, alliniacions de seqüències, resultats de docking, trayectòries i conjunts conformacionales.[1] Es poden crear imàgens i películes d'alta calitat. Chimera inclou una completa documentació i pot descarregar-se gratuïtament per a us no comercial.

Chimera ha segut desenrollat pel Resource for Biocomputing, Visualization, and Informatics (RBVI) de l'Universitat de Califòrnia, Sant Francisco. El desenroll està parcialment recolzat pels Instituts Nacionals de Salut. El programa de pròxima generació és UCSF ChimeraX.[2]

Junt en swissdock, ha segut usat per a simulació d'acoplament proteïna-lligant, lo que és essencial per al descobriment de noves dianes;[3] també ha segut usat per a visualisar superfícies de microcopía de fluorescència,[4] i, integrat en servicis web, permet un conjunt ampliat de funcions, inclosa la realisació de tasques de càlcul intensiu i busques en bases de senyes.[5]


Referències

  1. ↑ “UCSF Chimera-- un sistema de visualisació per a l'investigació i l'anàlisis exploratori” (2004). J Comput Chem 25 (13): 1605–12. doi:10.1002/jcc.20084. PMID 15264254.
  2. ↑ “Falta un títul per a la referència. Per favor, especifica el paràmetro title. {{{title}}}” . Protein Science: 14-25. doi:10.1002/pro.3235. PMID 28710774.
  3. ↑ «Docking with SwissDock».Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.).2053
    189–202.ISSN 1940-6029.doi:10.1007/978-1-4939-9752-7_12.Consultat el 2021-11-21.
  4. ↑ Li Bars, Romain; Bianchi, {{{nom2}}}; Lefebvre, {{{nom3}}} (2019). Three-Dimensional Surface Rendering of ESCRT Proteins Microscopy Data Using UCSF Chimera Software (en en), Springer, pp. 149–161. doi:10.1007/978-1-4939-9492-2_11. ISBN 978-1-4939-9492-2.
  5. ↑ «Enhancing UCSF Chimera through web services».Nucleic Acids Research.42(W1)
    W478–W484.ISSN 1362-4962.doi:10.1093/nar/gku377.Consultat el 2021-11-21.