Podoviridae
Podoviridae va ser una antiga família de virus infectivos para procariotas (bactèrias i estoves) que contenia 3 subfamílies, 52 gèneros i 130 espècies agrupats basat en la morfologia del virion. En 2023 la família va ser abolida junt en les d'atres caudovirus Myoviridae i Siphoviridae despuix de demostrar-se que són un conjunt polifilético, per lo que actualment el terme "podovirus" s'usa per a referir-se al morfotipo del virion d'estos caudovirus.[1]
Descripció
[editar | editar còdic]Els viriones dels podovirus tenen cápsides en #geometria icosaédricas i cap-coa. No posseïxen envoltura vírica. El diàmetro és d'al voltant de 60 nm, i consta de 72 capsòmers. Les proteïnas del cap té una massa molecular de 38 kiloDaltons i està present en 460 còpies per virión. Hi ha 9 proteïnes estructurals. La coa no és contràctil i té 6 fibres subterminales curtes. És gros, té forma de vareta i està construït en discs apilats. La llongitut màxima és de 17 nm.
El genoma és llineal i d'ADN bicatenario, d'al voltant de 40-42 kb de llongitut, i codifica 55 gens. El contingut de guanina + citosina és 50%. Tenen seqüències terminalmente redundantes i no estan permutades. En pes, el genoma constituïx 50% dels virus. El genoma codifica 9 proteïnes estructurals, una ADN polimerasa de tipo transferasa B adenilada i una ARN polimerasa. Tres proteïnes internes constituïxen el complex polimerasa. Es reconeixen dos classes de genés (primerenc i tardà). Esta classificació es basa en el moment de la transcripció que està regulat temporalment. Els gens en funcions relacionades s'agrupen. La replicació del genoma és bidireccional.
La replicació viral es produïx en el citoplasma. L'entrada en la cèlula hoste es conseguix per mig d'adsorció en la cèlula hoste. La replicació seguix el model de desplaçament de la cadena d'ADN. La transcripció en plantilla d'ADN és el método de transcripció. El virus ix de la cèlula hoste per lisis i proteïnes holina/endolisina/spanina. Les bactèries i estoves servixen com a hostes naturals. Les rutes de transmissió són per difusió passiva.
Es considera que HTVC010P, bacteriòfec de Pelagibacter ubique, és l'organisme més abundant de la Terra.[2]
Taxonomia
[editar | editar còdic]S'havia descrit les següents subfamílies i gèneros:
Els següents gèneros no havien segut assignats a una subfamília:
- Anjalivirus
- Astrithrvirus
- Badaztecvirus
- Baltimorevirus
- Bjornvirus
- Bruynoghevirus
- Burrovirus
- Chopinvirus
- Cimandefvirus
- Delislevirus
- Dybvigvirus
- Enhodamvirus
- Fipvunavirus
- Firingavirus
- Gervaisevirus
- Giessenvirus
- Hollowayvirus
- Jasminevirus
- Kafunavirus
- Kelquatrovirus
- Kochitakasuvirus
- Kozyakovvirus
- Krylovvirus
- Kuravirus
- Lahexavirus
- Lastavirus
- Lederbergvirus
- Lessievirus
- Lightbulbvirus
- Myxoctovirus
- Pagevirus
- Parlovirus
- Perisivirus
- Privateervirus
- Rauchvirus
- Ryyoungvirus
- Schmidvirus
- Sendosyvirus
- Skarprettervirus
- Sortsnevirus
- Uetakevirus
- Vicosavirus
- Wumpquatrovirus
- Wumptrevirus
- Xuquatrovirus
Referències
[editar | editar còdic]- Prescott, L.M. (199). [1], McGraw-Hill Interamericana d'Espanya, S.A.O..
- ↑ “Abolishment of morphology-based taxa and change to binomial species names: 2022 taxonomy update of the ICTV bacterial viruses subcommittee” . Archives of Virology 168 (2). doi:. PMID 36683075.
- ↑ Zhao, I.; Temperton, B.; Thrash, J. C.; Schwalbach, M. S.; Vergin, K. L.; Landry, Z. C.; Ellisman, M.; Deerinck, T.; Sullivan, M. B.; Giovannoni, S. J. (2013). "Abundant SAR11 viruses in the ocean". Nature. 494 (7437): 357–360. Bibcode:2013Natur.494..357Z. doi:10.1038/nature11921. PMID 23407494.
- Este artícul conté una traducció derivada de «Podoviridae» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.