Jmol
Jmol és un visor de còdic obert d'estructures químiques en 3D.[1] Jmol torna una representació tridimensional d'una molècula que pot usar-se com a ferramenta d'ensenyança[2] o per a l'investigació, per eixemple en química i bioquímica. És software lliure i de còdic obert, escrit en Java i per això es pot eixecutar en Windows, Mac OS X, Linux i sistemes Unix. Existix una aplicació independent i un kit de ferramentes de desenroll que pot integrar-se en atres aplicacions Java.
Característiques
[editar | editar còdic]La particularitat més notable és una miniaplicación (applet) que es pot integrar en pàgines web per a mostrar les molècules de moltes formes. Per eixemple, les molècules es poden mostrar com a models de "bola i pal", models "que omplin l'espai", models de "cinta", etc.[3] Jmol és compatible en una àmplia gama de formats d'archiu moleculars, incloent Protein Data Bank (PDB), archive d'informació cristalográfico (CIF), MDL Molfile (mol) i Chemical Markup Language (CML).
La miniaplicación Jmol, entre atres capacitats, oferix una alternativa al conector (plug-in) Chime, que ya no està baix desenroll actiu. Encara que Jmol té moltes característiques que no estan disponibles en Chime, no pretén reproduir tota la funcionalitat de Chime (en particular, el modo de Sculpt o esculpir). Chime requerix instalar un plug-in en Internet Explorer 6.0 o Firefox 2.0 de Microsoft Windows, o en Netscape Communicator 4.8 en MacintoshOS/9. Jmol requerix instalar Java i funciona en una àmplia varietat de plataformes. Per eixemple, Jmol és completament funcional en Mozilla Firefox, Internet Explorer, Opera, Google Chrome i Safari.
Imàgens
[editar | editar còdic]-
Estructura cristalina d'una ribonucleproteína en caixa H/ACA de Pyrococcus furiosus -
Dos ponts salinos en el tetrámero d'hemoglobina (el grup hemo es mostra com a varetes en la part inferior dreta). -
Un fragment del factor de transcripció TFIIIA en tres motius dit de zinc consecutius, unit a un segment de ADN. -
Ribosoma bacterià 70S de Thermus thermophilus.
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ Erro en la cita: L'element
<ref>no és vàlit; puix no n'hi ha una referència en text nomenadaChen2008 - ↑ Erro en la cita: L'element
<ref>no és vàlit; puix no n'hi ha una referència en text nomenadaHerraez2006 - ↑ Erro en la cita: L'element
<ref>no és vàlit; puix no n'hi ha una referència en text nomenadaHerraez2007
- Este artícul conté una traducció derivada de «Jmol» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.