Anar al contingut

Tamany del genoma

De L'Enciclopèdia, la wikipedia en valencià
Archiu:Genome Sizes.png
Rancs de tamany del genoma (en parells de bases) de vàries formes de vida

El tamany del genoma és la cantitat total de ADN contingut en una còpia d'un sol genoma complet. Per lo general, es medix en térmens de massa en picogramos (billonésimas (10-12 ) d'un gram, pg abreviat) o, en menys freqüència, en daltons, o com el número total de pares de bases de nucleòtits, generalment en megabases (millons de parells de bases, abreviat Mb o Mbp). Un picogramo equival a 978 megabases.[1] En els organismes diploides, el tamany del genoma a sovint s'usa indistintament en el terme valor C.

La complexitat d'un organisme no és directament proporcional al tamany del seu genoma; el contingut total de ADN és molt variable entre els tàxons biològics. Alguns organismes unicelulars tenen molt més ADN que els humans, per raons que encara no estan clares (ADN no codificante).

Orige del terme

[editar | editar còdic]
Archiu:Tree of life with genome size.svg
Arbre de la vida en tamanys de genoma com a barres exteriors (en número de gens, no en la cantitat total de ADN)

El terme "tamany del genoma" a sovint s'atribuïx erròneament a un artícul de 1976 de Ralph Hinegardner,[2] inclús en debats que tracten de terminologia.[3] Hinegardner[2] va usar el terme solament una volta: en el títul. De fet, el terme sembla haver aparegut per primera volta en 1968, quan Hinegardner es va preguntar, en l'últim paràgraf d'un atre artícul, si "el contingut de ADN celular reflectix, de fet, el tamany del genoma".[4] En este context, "tamany del genoma" s'usava en el sentit de genotip per a indicar el número de gens.


En un artícul presentat dos mesos despuix, Wolf et al. (1969)[5] va utilisar el terme "tamany del genoma" en tot moment i en el seu us actual; per lo tant, a estos autors provablement se'ls deu atribuir l'orige del terme en el seu sentit modern. A principis de la década de 1970, "tamany del genoma" era d'us comú en la seua definició actual, provablement com a resultat de la seua inclusió en l'influent llibre Evolution by Gene Duplication de Susumu Ohno, publicat en 1970.[6]

Variació en el tamany del genoma i el contingut de gens

[editar | editar còdic]

En l'aparició de diverses tècniques moleculars en els últims 50 anys, s'han analisat els tamanys del genoma de mils d'eucariota i estes senyes estan disponibles en bases de senyes en llínea per a animals, plantes i fongos (vore enllaços externs). El tamany del genoma nuclear generalment es medix en eucariota utilisant medicions densitométricas de núcleus teñir en Feulgen (anteriorment usant densitómetros especialisats, ara més comunament usant anàlisis d'imàgens computarizados[7] ) o citometría de fluix. En procariota, la electroforesis en gel de camp pulsat i la seqüenciació completa del genoma són els métodos predominants per a determinar el tamany del genoma.

És ben sabut que els tamanys dels genomes nuclears varien enormement entre les espècies eucariota. En els animals varien més de 3300 voltes, i en les plantes terrestres diferixen en un factor d'aproximadament 1000.[8] En els eucariota (pero no en els procariota), el tamany del genoma no és proporcional al número de gens presents en el genoma, una observació que es va considerar totalment contraria a l'intuïció abans del descobriment del ADN no codificante i que es va conéixer com el "paradoxa del valor-C".


El tamany del genoma es correlaciona en una varietat de característiques mesurables a nivell celular i d'organisme, inclós el tamany celular, la taxa de divisió celular i, segons el tàxon, el tamany corporal, la taxa metabòlica, la taxa de desenroll, la complexitat dels òrguens, la distribució geogràfica o el risc d'extinció.[9] Segons les senyes del genoma completament secuenciados disponibles a partir d'abril de 2009, el número de gens transformats logarítmicamente forma una correlació llineal en el tamany del genoma transformat logarítmicamente en bactèries, estoves, virus i orgànuls combinats, mentres que un logaritmo no llineal (seminatural) la correlació es veu per als eucariota.[10] Encara que açò últim contrasta en l'opinió anterior de que no existix correlació per als eucariota, la correlació no llineal observada per als eucariota pot reflectir un ADN no codificante que aumenta de manera desproporcionadament ràpida en genomes eucariota cada volta més grans. Encara que les senyes del genoma secuenciado estan pràcticament biaixats cap als genomes menuts, lo que pot comprometre la precisió de la correlació derivada empíricamente, i queda per obtindre la prova final de la correlació per mig de la seqüenciació d'alguns dels genomes eucarióticos més grans, les senyes actuals no semblen descartar una possible correlació.


Referències

[editar | editar còdic]
  1. Cytometry.51A(2)
    127–128.ISSN 0196-4763.doi:10.1002/cyto.a.10013.Consultat el 2022-11-18.
  2. 2,0 2,1 Hinegardner R (1976). «Evolution of genome size», F.J. Ayala (ed.). Molecular Evolution, Sinauer Associates, Inc., Sunderland, pp. 179–199.
  3. Annals of Botany.95(1)
    255–260.ISSN 0305-7364.doi:10.1093/aob/mci019.
  4. The American Naturalist.102(928)
    517–523.ISSN 0003-0147.doi:10.1086/282564.
  5. Humangenetik.7(3)
    240–244.ISSN 0018-7348.doi:10.1007/BF00273173.
  6. Ohno, Susumu (1970). Evolution by gene duplication., Allen & Unwin. OCLC 19724933. ISBN 0-04-575015-7.
  7. The Journal of Histochemistry and Cytochemistry: Official Journal of the Histochemistry Society.50(6)
    735–749.ISSN 0022-1554.doi:10.1177/002215540205000601.
  8. Gregory, T. Ryan (2005). The evolution of the genome, Elsevier Academic, pp. 89-162. OCLC 162572519. ISBN 978-0-12-301463-4.
  9. (2005) «Genome size evolution in plants», T.R. Gregory (ed.). The Evolution of the Genome, Sant Diego: Elsevier, pp. 89–162.
  10. PLoS ONE.4(9)
    i6978.ISSN 1932-6203.doi:10.1371/journal.posa.0006978.