Outrón
Un outrón és una seqüència de nucleòtits en l'extrem 5 'de la transcripció primària d'un gen que s'elimina per mig d'una forma especial d'empalme d'ARN durant la maduració del producte de ARN final. Mentres que les seqüències de intrones es troben dins del gen, les seqüències de outrón es troben fòra del gen.[1]
Característiques
[editar | editar còdic]El outrón és una seqüència similar a un intrón que posseïx característiques similars, com el contingut de G + C i un lloc acceptor de empalme que és la senyal per al empalme trans. Tal lloc de trans-empalme es definix essencialment com un lloc de empalme acceptor (3 ') sense un lloc de empalme donant aigües dalt (5').[2]
En eucariota, tals com euglenozoos, dinoflagelados, poriferos, nematodos, cnidarios, ctenóforos, platelmintos, braquiópodos, crustacis, quetognatos, rotíferos i urocordados, la llongitut del líder llongitudinalmente (SL) de outrones van de 30 a 102 nucleòtits (nt) , en l'exón SL llongitut que varia de 16 a 51 nt, i la llongitut completa de ARN SL que varia de 46 a 141 nt.[3]
Procés
[editar | editar còdic]En el empalme cis estàndart, es requerix el lloc de empalme del donant aigües dalt junt en un lloc acceptor ubicat en la posició aigües avall en la mateixa molècula pre-ARN. Pel contrari, el empalme trans SL es basa en un lloc de empalme del receptor 3 'en el outrón, i un lloc de empalme del donant 5' (dinucleótido GU) ubicat en una molècula de ARN separada, el ARN SL. Ademés, el outrón del ARNm prematur conté una adenosina ramificada, seguida d'un tracto de polipirimidina aigües avall, que interactua en la porció del intrón de ARN SL per a formar un subproducte ramificado 'I', que recorda al lazoestructura formada durant el empalme de intrones. La maquinària nuclear després resol esta estructura de ramificació 'I' per mig del empalme trans de la seqüència de ARN SL al sitie acceptor de la divisió trans 3 ' (dinucleótido AG) del pre-ARNm.[2][4]
Quan es processen els outrones, l'exón de SL es empalma en el trans lloc de aceptores distints, no apareados, aigües avall adjacents a cada marc de llectura obert del pre-ARNm policistrónico, lo que conduïx a transcripcions madures llimitades distintes.[5]
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ Conrad, Richard (25 de febrer de 1993). “Functional analysis of a C. elegans trans-splice acceptor” (en). Nucleic Acids Research 21 (4): 913–919. doi:. ISSN 0305-1048. PMID 8451190. PMC:309224.
- ↑ 2,0 2,1 Stover, Nicholas A.. “Spliced leader trans-splicing” (anglés). Current Biology 16 (1): R8–R9. doi:. ISSN 0960-9822. PMID 16401417.
- ↑ Lasda, Erika L. (1 de maig de 2011). “Trans-splicing” (en). Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA 2 (3): 417–434. doi:. PMID 21957027.
- ↑ Blumenthal, Thomas. “Caenorhabditis elegans operons: form and function” (en). Nature Reviews Genetics 4 (2): 110–118. doi:. ISSN 1471-0056. PMID 12560808.
- ↑ “Evolutionary Insights into RNA trans-Splicing in Vertebrates” . Genome Biology and Evolution 8 (3): 562–77. doi:. PMID 26966239.
- Este artícul conté una traducció derivada de «Outrón» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.