Critical Assessment of Prediction of Interactions
Critical Assessment of Prediction of Interactions (CAPRI) (Evaluació crítica de la predicció d'Interaccions) és un experiment comunitari del modelamiento estructural molecular de complexos proteics, també conegudes com acoplament proteïna-proteïna.
CAPRI[1] és una série d'events en a on varis investigadors de la comunitat científica intenten acoplar les mateixes proteïnes, donades pels evaluadores. Les rondes es porten a terme cada sis mesos. Cada ronda conté un a sis complexos proteïna-proteïna les estructures de la qual varen ser recentment determinades de forma experimental. Les coordenades són guardades secretament pels evaluadores, en la cooperació de biòlecs estructurals els qui les varen determinar. L'experiment CAPRI és doble cego, en el sentit que els participants no saben l'estructura resolta, i els evaluadores no saben la correspondència entre el resultat i l'identitat del creador d'este mateix.
Llista de servidors de prediccions participant en CAPRI
[editar | editar còdic]- ClusPro
- GRAMM-X
- FireDock
- HADDOCK [1] archivat en Wayback Machine. — High-Ambiguity-Driven protein–protein DOCKing
- pyDockWEB — Structural prediction of protein–protein interactions
- PatchDock
- SKE-DOCK
- SmoothDock
- 3D-Garden — Global and Restrained Docking Exploration Nexus
- TopDown
Referències
[editar | editar còdic]- ↑ Janin J, Henrick K, Moult J, Eyck LT, Sternberg MJ, Vajda S, Vakser I, Wodak SJ(2003).Proteins.52(1)
- 2–9.doi:10.1002/prot.10381.
- Este artícul conté una traducció derivada de «Critical Assessment of Prediction of Interactions» de Wikipedia en castellà publicada baix la Llicència de documentació lliure de GNU i la Llicència Creative Commons Reconeiximent-CompartirIgual 4.0 Internacional.